Rename dldp/dldp/heatmap_pred/split_main.sh to dldp/dldp/heatmap_pred/HPC_SC20/split_main.sh

split_main.sh

@@ -0,0 +1,40 @@
+#$ -cwd
+#$ -A  weizhe.li
+#$ -l h_rt=001:00:00
+#$ -S /bin/sh
+#$ -j y
+#$ -o sysout_main
+#$ -N split_main
+
+echo "Running job $JOB_ID on $HOSTNAME"
+
+QSUB=/opt/sge_root/bin/lx-amd64/qsub
+ARRAY_SCRIPT=split_grp.sh
+
+# Get params
+# source ./config.txt 
+# CNFG_FILE="./config_normal.txt"
+CNFG_FILE=$1
+source $CNFG_FILE 
+
+ls -1 $FILE_DIR > $LISTFILE
+
+mv $SPLIT_BASE_DIR "$SPLIT_BASE_DIR"_"$JOB_ID" 2>/dev/null
+mkdir -p $SPLIT_BASE_DIR
+
+SG_DIR=/scratch/mikem/UserSupport/weizhe.li/runs_split_group
+mkdir -p $SG_DIR
+BASE_DIR="$TYPE"_"$SG_DIR"/"$PATCH_SIZE"_"$SPLIT_SIZE"_"$JOB_ID"
+
+ST=1
+EN=`cat $LISTFILE | wc -l`
+SYSOUT_DIR="$BASE_DIR"/sysout
+mkdir -p $SYSOUT_DIR 
+
+
+# test
+# ST=1
+# EN=3
+
+echo "$QSUB -pe thread -t "$ST"-"$EN" -o $SYSOUT_DIR $ARRAY_SCRIPT"
+$QSUB -pe thread 1 -t "$ST"-"$EN" -o $SYSOUT_DIR -N sg_"$TYPE" $ARRAY_SCRIPT $CNFG_FILE