 Avik Datta
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794ffc606b
added github actions conf
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hace 3 años |
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Avik Datta
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f6034847a8
minor fix
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hace 3 años |
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Avik Datta
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f8e95a42f8
sending notification to channels after finishing transfer
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hace 3 años |
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Avik Datta
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eb1af6f092
new pipeline for demult report
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hace 3 años |
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Avik Datta
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f760c452a5
minor format change
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hace 3 años |
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Avik Datta
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57d647ef4d
fix for copy bam func
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hace 3 años |
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Avik Datta
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c271dfa4a4
fix for velocyto output
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hace 3 años |
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Avik Datta
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902e039a68
change for bam to cram conv
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hace 3 años |
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Avik Datta
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0bbf992a77
change for metrics summary path
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hace 3 años |
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Avik Datta
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7aedc24e5b
generating interop plots
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hace 3 años |
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Avik Datta
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2fcbf6dad5
added tasks for remote file copy
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hace 3 años |
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Avik Datta
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ccb6337997
bugfix
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hace 3 años |
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Avik Datta
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1848a09dfa
changing split count
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hace 3 años |
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Avik Datta
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e554ff6021
checking md5 in chunks
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hace 3 años |
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Avik Datta
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5fb95e2b3b
fix for tar extract and chmod
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hace 3 años |
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Avik Datta
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cc4e7d2b6e
switching to python operatop for tra extraction
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hace 3 años |
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Avik Datta
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25bcb8b2c0
moving jobs to generic queue
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hace 3 años |
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Avik Datta
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920b0b17d4
adding generic queue
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hace 3 años |
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Avik Datta
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710c44493d
switching to python operator
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hace 3 años |
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Avik Datta
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03c77d29c1
fix for ftp
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hace 3 años |
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Avik Datta
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1ceb217a1a
fix for ftp base path
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hace 3 años |
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Avik Datta
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c201da29b9
hpc sftp test
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hace 3 años |
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Avik Datta
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b12220e60a
minor change
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hace 3 años |
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Avik Datta
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ca0da64c33
minor changes
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hace 3 años |
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Avik Datta
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5c5a9638e4
using ftpoperator
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hace 3 años |
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Avik Datta
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dee6f5bc47
dag14 to use bash
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hace 3 años |
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Avik Datta
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669c802c8e
fix for hpc pipelines
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hace 3 años |
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Avik Datta
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b9d3f407b9
moving files download scripts to wells worker
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hace 3 años |
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Avik Datta
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9b1e004709
added docker-compose.yml for new celery worker
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hace 3 años |
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Avik Datta
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7552415204
added new dag for publication search and wiki update
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hace 3 años |
