 Avik Datta
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902e039a68
change for bam to cram conv
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hace 3 años |
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Avik Datta
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0bbf992a77
change for metrics summary path
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hace 3 años |
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Avik Datta
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7aedc24e5b
generating interop plots
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hace 3 años |
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Avik Datta
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2fcbf6dad5
added tasks for remote file copy
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hace 3 años |
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Avik Datta
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ccb6337997
bugfix
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hace 3 años |
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Avik Datta
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1848a09dfa
changing split count
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hace 3 años |
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Avik Datta
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e554ff6021
checking md5 in chunks
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hace 3 años |
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Avik Datta
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5fb95e2b3b
fix for tar extract and chmod
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hace 3 años |
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Avik Datta
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cc4e7d2b6e
switching to python operatop for tra extraction
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hace 3 años |
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Avik Datta
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25bcb8b2c0
moving jobs to generic queue
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hace 3 años |
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Avik Datta
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920b0b17d4
adding generic queue
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hace 3 años |
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Avik Datta
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710c44493d
switching to python operator
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hace 3 años |
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Avik Datta
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03c77d29c1
fix for ftp
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hace 3 años |
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Avik Datta
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1ceb217a1a
fix for ftp base path
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hace 3 años |
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Avik Datta
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c201da29b9
hpc sftp test
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hace 3 años |
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Avik Datta
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b12220e60a
minor change
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hace 3 años |
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Avik Datta
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ca0da64c33
minor changes
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hace 3 años |
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Avik Datta
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5c5a9638e4
using ftpoperator
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hace 3 años |
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Avik Datta
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dee6f5bc47
dag14 to use bash
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hace 3 años |
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Avik Datta
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669c802c8e
fix for hpc pipelines
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hace 3 años |
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Avik Datta
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b9d3f407b9
moving files download scripts to wells worker
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hace 3 años |
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Avik Datta
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9b1e004709
added docker-compose.yml for new celery worker
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hace 3 años |
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Avik Datta
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7552415204
added new dag for publication search and wiki update
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hace 3 años |
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Avik Datta
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8c54f35c95
commented import
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hace 3 años |
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Avik Datta
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5b19fb020a
added dir move cmds
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hace 3 años |
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Avik Datta
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69b5bb635a
switching to old shell scripts
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hace 3 años |
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Avik Datta
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fbf69ef354
downloading tar files directly on hpc
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hace 3 años |
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Avik Datta
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4d29f38abf
added options for tar
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hace 3 años |
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Avik Datta
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e45674f72a
added step for extracting run
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hace 3 años |
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Avik Datta
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bd937298f6
more minor changes
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hace 3 años |
