 Avik Datta
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923dee7da4
minor changes
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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c3d5c46efe
updated var
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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88423f7610
change of job class
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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72eea08c77
updated scvelo task
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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48bc4ef0ef
changed job class
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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8f3dd2e145
new job class for velocyto task
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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3d276283d0
longer hpc worker
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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d5a5efd309
adding the demult notebooks
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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f3845e415d
minor changes
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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9bdd9fd302
updated var file
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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730ec8c3ab
removed ambiguous vdj tasks
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vor 3 Jahren |
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Avik Datta
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a804aa9697
added new vars
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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1f24e57067
added samtools image path to var json
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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5bf9f83100
changed features to dictionary
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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5876305ac2
passing task as list from variable
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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a5f0e62237
updated vars list
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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253b1a95d4
added seqrun ml notebook
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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6ec79cdc6a
added interop notebook runner
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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e6cdf37def
fix for immuno analysis list
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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a4b759e412
fixed var
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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4715c4d4d6
moved hpc job settings to variable conf file
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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eddc9b82cd
sc dual index json
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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833d038f6d
added testdb
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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f639099209
uodated dag9
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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054fadc6a9
added function for analysis file load to db
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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d4bf855f9c
added functions for scanpy and scirpy notebook runner
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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7360aeb473
updates
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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40286f2e5b
sc 5' analysis list
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vor 4 Jahren |
 Avik Datta
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fecbc82e7a
added extra vars for airflow
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vor 4 Jahren |
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Avik Datta
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cbb800b53a
updated default confs
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vor 4 Jahren |
