 Avik Datta
|
923dee7da4
minor changes
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
c3d5c46efe
updated var
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
88423f7610
change of job class
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
72eea08c77
updated scvelo task
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
48bc4ef0ef
changed job class
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
8f3dd2e145
new job class for velocyto task
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
3d276283d0
longer hpc worker
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
d5a5efd309
adding the demult notebooks
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
f3845e415d
minor changes
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
9bdd9fd302
updated var file
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
730ec8c3ab
removed ambiguous vdj tasks
|
3 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
a804aa9697
added new vars
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
1f24e57067
added samtools image path to var json
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
5bf9f83100
changed features to dictionary
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
5876305ac2
passing task as list from variable
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
a5f0e62237
updated vars list
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
253b1a95d4
added seqrun ml notebook
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
6ec79cdc6a
added interop notebook runner
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
e6cdf37def
fix for immuno analysis list
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
a4b759e412
fixed var
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
4715c4d4d6
moved hpc job settings to variable conf file
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
eddc9b82cd
sc dual index json
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
833d038f6d
added testdb
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
f639099209
uodated dag9
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
054fadc6a9
added function for analysis file load to db
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
d4bf855f9c
added functions for scanpy and scirpy notebook runner
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
7360aeb473
updates
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
40286f2e5b
sc 5' analysis list
|
4 vuotta sitten |
 Avik Datta
|
fecbc82e7a
added extra vars for airflow
|
4 vuotta sitten |
|
Avik Datta
|
cbb800b53a
updated default confs
|
4 vuotta sitten |
